Помимо регистрации в налоговой инспекции, для Общества с ограниченной ответственностью необходимо пройти процедуру постановки на учет в государственных внебюджетных фондах - в Пенсионном фонде, в Фонде обязательного медицинского страхования и Фонде социального страхования.
Регистрация юридических лиц в Пенсионном фонде РФ (ПФР) производится на основании сведений из ЕГРЮЛ, представляемых налоговым органом. После получения сведений в электронном виде Отделение ПФР должно произвести регистрацию ООО в Пенсионном фонде в течение 5-ти дней. Постановка на учет в Пенсионном фонде по месту нахождения ООО осуществляется на основе следующих документов: заявления о регистрации, копии свидетельства о государственной регистрации и постановке на налоговый учет, копии учредительных документов, письма Госкомстата. Для подтверждения постановки на учет ООО присваивается регистрационный номер и выдается «Извещение страхователя». Как правило, извещение отправляется на юридический адрес, указанный в документах Общества с ограниченной ответственностью, однако его можно получить и в территориальном органе ПФР. За отказ от регистрации и за нарушение сроков постановки на учет в Пенсионный фонд для ООО предусмотрена административная ответственность в виде штрафов.
Регистрация в Фонде обязательного медицинского страхования (ФОМС) осуществляется по той же схеме и в тот же срок, что и постановка на учет в Пенсионном фонде. Для постановки на учет ООО в органах ФОМС по месту своего нахождения требуются аналогичные документы, что и для регистрации в ПФР. После регистрации Обществу с ограниченной ответственностью присваивается регистрационный номер и выдается извещение о постановке на учет. Извещение может быть получено в территориальном Фонде ОМС или по почте. В случае если по истечении 10 дней после регистрации ООО не была осуществлена постановка на учет в ФОМС, Общество будет обязано выплатить штраф. Постановка на учет в Фонде социального страхования (ФСС) аналогична процедуре регистрации в ПФР и ФОМС. После постановки на учет в ФСС Обществу с ограниченной ответственностью присваивается регистрационный номер и выдается свидетельство, а также уведомление о страховых взносах на соцстрахование от несчастных случаев на производстве или от профессиональных заболеваний.